Søkadet 1837, sekondløjtnant i marinen 1843. Deltog i et togt til Nordafrika og Vestindien 1845-46 og var derefter styrmand på et handelsselskab til Brasilien 1847-48. Under Treårskrigen tjeneste på fregatten "Thetis" på blokadevagt i Nordsøen. Næstkommanderende for en flådestyrke til forsvar af Vesterhavsøerne 1850. Efter krigens afslutning udnævnt til premierløjtnant og konstitueret som inspektør for Krydstold-,Fyr- og Vagervæsenet på Slesvigs vestkyst. I 1854 fastansat i denne stilling og afgik samtidig fra marinen. Indtrådte igen i tjenesten ved udbruddet af krigen i 1864, nu med grad af kaptajnløjtnant. På grund af sit indgående kendskab til Vesterhavsøerne og farvandet omkring dem fik han ledelsen af øernes forsvar. Denne opgave udførte Hammer med en dygtighed, som også vakte beundring for den preussisk-østrigske modstander, men den 19. juli 1864 måtte han overgive sig. Modtog efter krigen en æressabel fra Vesterhavsøernes dansksindede befolkning som tak for sin indsats. Oprettede 1865 "Det danske Fiskeriselskab", som drev hval- og sælfangst i Nordatlanten. Selskabet måtte dog indstille sin virksomhed 1871. I sine senere år drev Hammer et savværk i Sverige. Kommandør af Dannebrogsordenen 1864.