Gunner blev gift med Vibeke Sørensen den 21 maj 1902 i Mathæuskirken I København, og blev skilt den 20 okt. 1910. Vibeke (datter af Johan Ditlev Sørensen og Louise Theresia f. Ploug) blev født den 30 mar. 1879. [Gruppeskema] [Familietavle]
Gunner blev gift med Ellen Barfoed den 28 jan. 1911 i Vartov kirke i København. Ellen (datter af Magnus Barfoed og Thora Mathilde Unmack) blev født den 17 apr. 1876 i Helsingør; døde den 24 nov. 1928 i Lyngby. [Gruppeskema] [Familietavle]
Gunner blev gift med Erna Eleonora Augusta Doile [Gruppeskema] [Familietavle]
Eleonora blev gift med Peder Dorph Broager [Gruppeskema] [Familietavle]